要解锁千门虚舟秘境，首先需要完成前置任务神樱大祓-荒海(祓行)。该任务位于稻妻地区的荒海区域，完成后才能解除恒常机关阵列附近的空气墙障碍。任务过程中需解开荒海大祓旁的雷立方机关，通过击打雷立方让5个立方体转向同一面，水位会首次下降。随后在上层找到第二个雷立方机关并解开，水位完全下降后即可开启控制机关门。
解锁恒常机关阵列传送点后，从该房间右侧的藤条攀爬至顶部。此处会出现第一个方块迷阵解密关卡，需按照特定顺序踩亮地块。完成第一个迷阵后继续前进，会遇到第二个相同机制的方块迷阵，同样需要按照指定走法解密。两个迷阵均正确解谜后，秘境巨石将自动炸开，千门虚舟秘境大门会从地面升起。发蓝光的格子必须最后踩踏，这是解谜的关键顺序。
另一种进入方式是从刃连岛的黑洞跃迁。在刃连岛上存在可直接传送到恒常机关阵列的传送阵，但这种方式仍需先完成荒海地区的机关解谜才能激活秘境入口。无论采用哪种路径，最终都需要完成两个一笔画机关的解密流程。该解谜机制要求玩家从起点不回头地连续走完全部格子，中途不可重复踩踏。
秘境解锁后会获得原石、雷之印等奖励。雷之印可用于提升神樱眷顾等级以解锁更多奖励。探索过程中还会发现隐藏的小狐狸雕像，扫描后可获得圣遗物强化材料和特殊对话内容。秘境背景设定为沉入海下的天狗别馆，曾作为影向役者三人众的居所，这些细节可通过环境叙事逐步了解。
整个解锁过程主要依赖环境解谜而非战斗，建议携带具有位移技能的角色便于攀爬和移动。若在荒海区域未发现解谜机关，需确认是否已完成全部前置任务步骤。部分玩家可能会忽略水位下降后出现的第二个雷立方机关，这是导致卡关的常见原因。解密过程中若出现错误，退出战斗状态后机关会自动重置。
该秘境作为一次性挑战副本，通关后不可重复获取主要奖励，但可以反复进入收集遗漏的探索要素。其设计融合了稻妻特色的机关阵列与空间结构，解谜难度适中，主要考验玩家对机关机制的观察力和路径规划能力。后续版本更新可能会调整部分解谜逻辑，但核心解锁流程保持不变。
